До настоящего времени этот музей является единственным музеем в России, который посвящен подводным силам РФ. На сегодняшний день он содержит приблизительно 17 тысяч экспонатов, которые размещены всего в двух залах.

Для детей в музее проводятся специальные экскурсии, в ходе которых юные посетители могут увидеть такие необычные экспонаты как, например, консервы с водой, используемые на подводной лодке, познакомиться с таблицей перестукиваний между отсеками в случае аварии, и увидеть самую настоящую торпеду "в разрезе", получив комментарии ко всем её частям и деталям.

Здесь хранится множество картин с изображением на них подводных судов разных лет. Также в музее находятся предметы, рассказывающие об условиях, в которых пребывали люди на подводных лодках. С давних времен сохранилась военная форма, знамена и ордена, которые в настоящее время может посмотреть любой желающий.

В музее расположено множество экспонатов, представляющих собой предметы, сохранившиеся с подводной лодки С-13, капитаном которой был легендарный А.И. Маринеско. Особое место в музее занимает экспозиция, посвященная печально известной подводной лодке «Курск». Также на территории музея располагается настоящая подводная лодка, в которую в теплое время года организуются экскурсии.